Для того, чтобы провести ревизию лицензий - использовались различные инструменты из маркета Atlassian (аддоны) и скрипт PS, для удаления неактивных пользователей. Список неактивных пользователей формировался из установленных аддонов.
Используемые плагины для JIRA
Admin Tools for JIRA
Используемые плагины для Confluence
User Management for Confluence